Enzymes

1. Définition

Certaines enzymes ne peuvent avoir d’activité catalytique qu’en présence d’une molécule organique spécifique, et de faible poids moléculaire : coenzyme. (souvent il faut au niveau du site actif un ion métallique comme Zn2+ dans les carboxypeptidases : c’est une molécule aidant un catalyseur, ce n’est pas un coenzyme).

Si une coenzyme est nécessaire, le système s’appelle une holoenzyme. Elle est formée de :

• chaîne peptidique : apoenzyme

• coenzyme liée à l’enzyme

par des liaisons faibles : hydrogène, Van der Waals le plus souvent

rarement par des liaison covalentes : le coenzyme est fixé dans le site actif de l’enzyme.

2. Rôle des coenzyme comme réactif de transfert de groupe : cosubstrats

Certaines coenzymes se présentent comme des cosubstrats

Exemple du transfert de deux H sur l’acide pyruvique (produit final de la glycolyse) pour donner l’acide lactique :

NAD est considéré comme cosubstrat.

L’enzyme s’appelle lacticodéshydrogénase car elle fonctionne dans les 2 sens en fonction des concentrations des différents substrats.

(La lacticodéshydrogénase a une grande importance dans la glycolyse anaérobie.)

Certains coenzymes peuvent transférer des groupes fonctionnels sur d’autres molécules :

 le coenzyme sert de transporteur entre D et A (cf a. pyruvique).

3. Etude de coenzymes

a) coenzymes à structure nucléotidique

i ATP : adénosine triphosphate : rôle de transporteur

• d’acide phosphorique

• d’énergie par couplage réactionnel pour que la réaction ait G < 0

ii coenzymes pyrimidiques = amides nicotiniques : dérivés de vit PP. 2 principaux :

NAD : nicotinamide adénine di nucléotide

NADP = NAD phosphorylée

ce sont des transporteurs d’H

iii coenzymes flaviniques : dérivés de la vit B2

FMN : flavine mono nucléotide

FAD : flavine adénine di nucléotide.

Ce sont des transporteurs d’hydrogène FAD  FADH2.

iv coenzyme A : dérivé de l’acide panthoténique : vit B5.

agit par l’intermédiaire d’une fonction thiol à l’extrémité du coenzyme : -SH : partie active qui permet de fixer notamment la fonction carboxylique des acides gras.

ex

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