Infection et hygiène

U.E.2.10. – Infectiologie et hygiène

        Découverte des micro-organisme pathogènes, vers 1850

Beaucoup de maladies infectieuses = mort

        21ème siècle, fréquence maladie diminue

Raison = amélioration, niveau de vie, alimentation, hygiène, accès aux soins.

        Mais, voyager = dissémination et contamination augmenter

Nouvelles maladies dans nouvelles localisations

1. Présentation des agents infectieux

Un agent infectieux est un facteur de risque de l'environnement microbiologique qui peut causer une infection

Infection : pénétration dans un organisme d'un agent infectieux capable de s'y multiplier et d'y induire des lésions pathologiques

On en distingue différent type :

• La plupart sont des micro-organismes vivants
• Qui se déplacent
• Respirent, se nourrissent
• Se reproduisent par voie sexuée ou asexuée
• À l’extérieur ou en lien à l'intérieur de l'organisme

Caractéristique :

• Pouvoir pathogène

Se dit d'un agent qui à le pouvoir de provoquer une maladie

• Signe de l'infection : douleurs, dysfonctionnement
• Douleur de préférence : organe, tissu

• Virulence

• Pouvoir de se répendre et de se multiplier, malgré défenses immunitaires
• Dépend du nombre, toxines fabriquées, stratégies de protection

• Réservoirs des agents infectieux

• C'est l'habitat naturel, endroits où il se maintient, se multiplie
• Se l’homme : endogène = (intérieur) flore bactérienne

                                         (extérieur) environnement du patient

• Animal, environnement : eau, air, surfaces

• Acellulaires, unicellulaires, pluricellulaires

1.  Acellulaires

1.1. Les prions

Agents transmissibles non conventionnels (ATNC)

L'agent infectieux est une glycoprotéine

1.2. Les virus

Taille : quelque nanomètres (10-9m), 100 fois plus petit qu'une bactérie

• Vivants à l'intérieur d'une cellule-hôte et inertes à l'extérieur
• Toujours parasites d'une cellule (plante, animaux, bactérie)

Reproduction : ne se multiplient que dans une cellule-hôte

La structure d'un virus :

• Le génome viral est composé d'un seul acide nucléique

• Constitué soit d'ADN (2 chaines) ou d'ARN (une chaine)
• Constitué d'une quinzaine de gènes en moyenne

• Le génome est enveloppé dans une menteau protéique protecteur = la capside

• Conformation géométrique, tubulaire ou polyédrique.

• Une enveloppe externe facultative, lipoprotéique entourant la capside de certains virus : le peplos

• Si pas d'enveloppe : virus nus, résistants
• Si présence d'une enveloppe : virus enveloppés

• Sont plus fragiles car formé d'une membrane sensible à la chaleur et à la dessiccation
• Conséquence de cette structure très simplifiée : incapacité de se diviser de façon autonome

Classification :

• Dizaines de milliers de virus différents
• La classification repose sur

• La structure du génome : ADN ou ARN
• La conformation de la capside
• Présence ou absence d'une enveloppe

2.1. Les bactéries

• Observés pour la 1ère fois, fin 17ème par Van Leeuwenhoeck
• Il fabrique un microscope et observe des « animalcules »
• Pasteur, milieu 19ème : « bactérie »
• Mr Koch a montré l'association entre une bactérie donnée et une maladie (Bacille de Koch et tuberculose)
• Présents dans la plupart des environnements naturels

• Eau
• Sol
• Sur les organismes vivants : plantes, animaux, humains

 Bactérie : Une bactérie est une cellule procaryote (pas de noyau) : Amas de matière biologique entournée d'une membrane et contenant tous les éléments nécessaires à sa reproduction.

• Nombreuses utilisations par l'Homme

• Fabrication et conservation d'aliments : fromages, yaourt, vinaigre, vi, bière
• Recyclage de l'eau dans les stations d'épuration
• Digestion de certains polluants (pétrole)
• Génie génétique : insertion d'un gène et « usine de production » de protéines/médicaments : insuline

• Capable d'adaptation à l'environnement
• Participent au recyclage de la matière vivante
• Beaucoup de bactéries non pathogènes nous accompagnent

• Dans l'intestin, digestion
• Sur la peau, protection

• Certaines sont pathogènes => infections
• Différents classements

• Ex : Escherichia coli

nom de genre           nom de l'espèce  

Structure d'une bactérie :

• Taille de 1 à 10µm, visible au microscope optique
• Constituée de 70% d'eau, protéines, lipides, glucides, acides nucléiques : ADN, ARN
• Le matériel génétique : ADN qui flotte dans le cytosol

• Un seul chromosome circulaire
• Des plasmides = petites boucles d'ADN, mini-chromosomes facultatifs (1 à 3% du génome)

• La membrane plasmique est constituée par une double couche de phospholipides
• La paroi bactérienne est composée d'une substance de base : le peptidoglycane : glycoprotéine complexe

La paroi :

• Optionnelle, coque protectrice rigide et résistante
• Donne sa forme à la bactérie, « squelette externe »
• Est colorable par la méthode de GRAM

• Affinité de colorant => distinction

• Support de l'action de certains antibiotiques, qui bloque la formation du peptidoglycane (pénicilline)

En bâtonnets : Les bacilles

En spirale : Les spirilles ou spirochètes

Sphériques ; Les coques

CF figure 4

Bactérie Gram + :

• Peptidoglycane (constituant majeur, 90%)

Bactérie Gram - :

• Peptidoglycane (peu, 5 à 20%) + lipides, glucides, protéines

Coloration Gram

Structure facultatives :

• La capsule : facultative (polysaccharides) superficielle, donne un pouvoir pathogène, empêche la phagocytose
• Le(s) flagelle(s) : prolongements fins pour la locomotion
• Le(s) pilus (pili) : appendice à la surface de certaines bactéries, pour attachement cellulaire entre bactérie

Conditions de survie, besoins nutritifs

• Eau
• Température entre 30 et 40°C (froids glaciaires et sources hydrothermales)
• pH entre 5,5 et 9 (toutes valeurs)
• Besoin en oxygène

• Bactérie aérobie (milieu avec oxygène)
• Bactérie anaérobie (sans oxygène)
• Bactérie aéro-anaérobie

• Se nourrissent de matières organiques

Particularité des bactéries : la sporulation

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