Microbiologie : Les bases de la Microbiologie

Introduction à la Microbiologie

1. Historique de la Découverte des Micro-organismes

• Microbiologie : Science qui étudie les micro-organismes
• Micro-organisme : Invisibles à l’œil nu (< 0.1mm) ; Unicellulaire ou Multicellulaire ; environ 60 % de la biomasse totale de la biosphère

Avant 1715 : Infections = magie ; génération spontanée ; climat…

1715 : 1er Micro-organisme -> Découverte des Animalcules

1860 : Fermentation ; Pasteurisation ; Vaccination…

1882 : Bacille de Coque ; Vaccination …

1928 : 1er Antibiotique = Pénicilline

1. Place des Micro-organismes dans la classification du vivant

Avant découverte des Micro-organismes :

2 règnes : Animal et Végétal

• Animal :

• Energie = Dégradation de matière organique
• Réserves = Graisses ou Glycogènes
• Mouvements actifs et cellules sans paroi

• Végétaux :

• Photosynthèse (lumière)
• Réserve nutritive = amidon
• Pas de mouvements actifs et cellules avec paroi

Après découverte des Micro-organismes :

• Classification plus complexe[pic 1]
• 1986 : Haecke créa 3ème règne = Les Protistes [pic 2]
• Ajout rapide d’un 4ème = Les Virus

Classification Biologique :

• Végétaux et Animaux : Pluriȼ ; différenciation ȼ très poussée -> chacune intervient sur fonctionnement de l’organisme entier = société cellulaire.
• Protistes : Uni/Pluriȼ ; pas de différenciation -> pas de spécialisation ; peuvent être indépendantes.

• Protistes supérieurs ou Eucaryotes : Algues (pas cyanobactéries) ; Protozoaires ; Champignons
• Inférieurs ou Procaryotes : Algues bleu-vert (cyanobactéries) ; Bactéries/ Eubactéries

• Virus : Organismes à organisation NON ȼ

Classification Actuelle :

• Selon nombrx critères (type de ȼ ; organisation ; nutrition ; reproduction…)
• Ajout règne Archées (bactéries archaïques) éloignées des procaryotes

-> Classification en 6 règnes (fortement controversée) :

• Animalae ; Plantae ; Fungi (mycètes) ; Protista (eucaryotes uniȼ) ; Procaryotae ; Archeobacteries

1. Diversité du monde microbien

1. Différents types de micro-organismes

• Monde Microbien :[pic 3]

[pic 4][pic 5][pic 6]

Certains plus étudiés que d’autres car peuvent être nuisibles ou d’un intérêt particulier et utiles => Moyens pour se défendre

1. Exemples de Micro-organismes :

Néfastes :

• Responsables de Pathologies : Virus et Bactéries ; Mycètes ; Protozoaires (Toxoplasma ; Plasmodium ; Amibes)
• Responsables de l’altération des aliments : Moisissures (dégradation d’aliments)

Utiles :

• Utiles dans alimentation : Levures de Bière ; Bactéries Yaourts ; Penicillium
• Comestibles : Champignons à chapeaux
• Utilisés dans l’industrie pharmaceutique ou recherche scientifique : Antibiotiques (via Moisissures) ; Protéines recombinantes dans M-OGM
• Utilisés dans la dépollution : Bactéries se nourrissant de matières org des eaux usées

1. Morphologie et ultrastructure de certains micro-organismes

1. Micro-organismes Procaryotes : Bactéries

1. Micro-organismes Eucaryotes :

1. Les protistes

• Eucaryotes uniȼ classés en fonction des affinités végétales ; animales ou fongiques

• Algues uniȼ ou protophytes (présence chloroplastes)
• Animaux uniȼ ou protozoaires

• Protozoaires : Pas de photosynthèse ; aptes à ingérer des proies via une bouche temporaire (Amibiens) ou permanente (ciliés) -> ex :

• Paramécies : Dans eau croupies avec déplacements rapides par cils vibratoires
• Amibes : + souvent dans eau, peuvent être des parasites intestinaux = amibiases

• Champignons uniȼ ou levures (aussi classés groupes mycètes)

• Confusion entre nature protiste/mycète car certains peuvent bourgeonner et former un pseudo mycélium

• Ils sont microscopiques (10-15 µm)
• Nombreux ont une paroi protectrice

• Les mobiles se déplacent grâce à :

• Flagelles (souvent pairs)
• Cils (tout autour)
• Par glissement via pseudopodes (expansion de la ȼ)

1. Les mycètes ou Fungi

• Organismes eucaryotes sans chloroplastes (= chimiotrophes)

• Porteurs de spores
• Capables de reproduction sexuée (spores) ou asexuée (app végétatif = le thalle)
• Plupart ont thalles pluriȼ avec un mycélium (champignons filamenteux ou moisissures)
• Sont autant bénéfiques que nuisibles :

• Décomposent mats orgs complexes en substances simples
• Cause nombreuses maladies -> Humain : intoxication alimentaire ; infections/ mycoses

• Les Levures :

• Proches des ȼ animales mais entouré d’une paroi glucidique (chitine)
• Rondes ou ovales
• 10x plus grandes que les bactéries
• Pas de flagelle (immobiles)
• Reproduction : Asexuée (bourgeons par mitose) ; Sexuée (spores)

[pic 7]

• Les Moisissures :

• Mycètes pluriȼ ; composées de filaments = mycélium ; classés par la structure du thalle et mode de formation de spores
• Exemples de Structures : Zygomycètes et Ascomycètes

1. Les virus

• Particules simples acellulaires
• Ne peut se multiplier que dans les ȼ vivantes = parasites intraȼ obligatoires
• 10-100 µm (bcp + petit que ȼ)

Classification des virus est basée sur les caractéristiques :

• Acide Nucléique
• Symétrie de la capsule
• Présence/Absence d’enveloppe (Virus nu ou enveloppé)
• Type d’hôte : ȼ Végétales = Phytovirus ; ȼ Bactériennes = Bactériophages ; ȼ Animales

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