TP La relation antigène – anticorps

TP La relation antigène – anticorps

L’immunité adaptative, prolongement de l’immunité innée.

Les anticorps – ou immunoglobulines (IgG) – ont la capacité de neutraliser les antigènes selon une réaction spécifique durant laquelle l’anticorps se fixe sur l’antigène.

Mise en situation :

Le dépistage du VIH est réalisé notamment par le test Elisa qui consiste à rechercher dans le plasma d’une personne la présence d’anticorps anti-VIH (exemples : anticorps anti-gp120, anti-gp41 ou anti-p24, voir document1). Une personne est séropositive lorsqu’on détecte la présence d’anticorps anti-VIH dans son plasma. On suppose donc que les anticorps produits sont spécifiques d’une molécule donnée (antigène).

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Problématique : On cherche à connaître l’organisation de la molécule d’anticorps pour comprendre la réaction de neutralisation (réaction antigène-anticorps).

A partir des ressources proposées et du matériel fourni, démontrez que les anticorps sont des molécules spécifiques d’un antigène et expliquez les origines moléculaires et génétiques de cette spécificité.

Matériel :

- ordinateur avec logiciel ANAGENE et logiciel RASTOP,

- fiches techniques de chaque logiciel,

- fichier ANAGENE « igg-sida-4chaines.EDI » (séquences polypeptidiques des quatre chaînes d’un anticorps humain anti-VIH) et « igg-vih-8seq.EDI » (séquences comparées de deux chaînes de 4 anticorps chez une même personne), à chercher sur le serveur (Ma classe – SVT – Documents en consultation – Relation Ag-Ac).

- fichiers RASTOP «IGGTOTAL.PDB » (anticorps complet), «IGG-LYS.PDB» (fragment d’anticorps ayant fixé l’antigène) et « 1E6J.PDB » IgG contre un épitope de l’antigène p24 du VIH à chercher sur le serveur.

Objectifs :

- montrer que les anticorps sont des protéines constituées d'une partie constante et d'une partie variable ;

- montrer que la spécificité des anticorps est due à la partie variable.

1 – Etude de l'organisation générale d'un anticorps circulant. 

1.1 Logiciel RASTOP :

1. Charger le fichier « iggtotal.pdb » ;

2. Mettre en évidence les chaînes puis les ponts disulfures (Liaisons 🡪 Ponts disulfures 🡪 Type 🡪 Bâtonnets 🡪 Rayon (250 R.U) 🡪Palette de couleur 🡪 Sélectionner « ponts disulfures » 🡪 Rouge

• Insérer une image de votre production.

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1.2 Logiciel ANAGENE :

1. Charger le fichier « igg-sida-4chaines.edi »

2. Faites une comparaison simple des séquences « igg h sida.pro » et « igg i sida.pro », puis une comparaison simple des séquences « igg l sida.pro » et « igg m sida.pro ».

Remarque : h et i sont dites chaines lourdes, tandis que l et m sont dites chaines légères.

• Insérer une image de votre production.

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🡪 Comment sont constituées les séquences d’acides aminés d’un anticorps ?

Les anticorps sont composés de protéines, qui forment quatre chaines polypeptidiques deux chaines lourdes et deux chaines légères qui sont identiques entre elles. En effet quand on les observe sur le logiciel anagène, elles n’ont aucune différence, les deux chaines légères sont composées des mêmes acides aminés, et sont de mêmes longueurs, de même pour les chaines lourdes. Les chaines légères sont composées de 645 acides aminés et les chaines lourdes environ 1370.

2 –  épitope de l’antigène gp120 (protéine de l’enveloppe virale qui se lie au récepteur CD4 des cellules cibles du VIH ; cette protéine est codée par le gène « env » du virus) ;

- 1F58 = IgG contre un autre épitope de l’antigène gp120 ;

- 1E6J = IgG contre un épitope de l’antigène p24 (protéine formant la couche protéique interne du core du virus VIH ; cette protéine est codée par le gène « gag » du virus) ;

- 1NLD = IgG contre un épitope de l’antigène gp41 (protéine de l’enveloppe virale associée à la protéine gp120 et nécessaire à la fusion de cette enveloppe avec la membrane des cellules parasitées ; cette protéine est codée par le gène « env » du virus).

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