Biologie moléculaire / controle

Contrôle terminal EDST2BEM- durée 1 heure – 12 mai 2021

Cocher la (ou les) proposition(s) juste(s) à chaque question. Il y a entre 1 et 3 propositions justes par question.

Conseil: Il vous est conseillé d’utiliser ce sujet comme un brouillon en entourant d’abord la ou les propositions justes de chaque question sur ce sujet ; puis, quand vous êtes sûrs de vous, remplissez la grille de réponses. Sur cette grille, vous disposez d’une seconde ligne (ligne de repentance) pour chaque question afin de modifier votre réponse si vous le souhaitez. Si cette deuxième ligne est cochée, ce sera la seule à être prise en compte. Si, finalement, vous ne souhaitez plus répondre à une question, cochez la case d’annulation.

Barème appliqué: pour obtenir les points attribués à chaque question, l’ensemble des propositions justes à cette question doit être coché et aucune proposition fausse ne doit être cochée.

Si une proposition juste n’est pas cochée ou si une proposition fausse est cochée, aucun point n’est obtenu à la question.

Si aucune case n’est cochée ou si vous cochez la case d’annulation, aucun point n’est obtenu.

Il n’y a pas de points négatifs

A- Questions de cours/TD :        en rouge les réponses justes

1. En criminalistique, l’ADN peut servir de marqueur pour identifier un être humain. Pour cela, l’ADN étudié correspond généralement à :

1. Des vecteurs
2. Des séquences répétées hautement variables de type STR (microsatellites)
3. Des séquences uniques

1. Le génie génétique (obtention de vecteur recombinant) peut être utilisé pour :

1. La production d’anticorps
2. La mise en place de vaccins
3. La synthèse d’huiles essentielles

1. Une molécule d’ARN est composée :

1. De ribose
2. De groupements phosphate
3. De bases puriques et pyrimidiques

1. Un spectrophotomètre peut être utilisé pour déterminer la concentration d’une solution:

1. de protéines
2. d’ ADN
3. de bactéries

1. Lors d’une hybridation moléculaire, les deux molécules concernées peuvent être :

1. n’importe quel type d’acide nucléique et une protéine
2. 1 molécule d’ADN génomique et un oligonucléotide
3. 1 fragment de restriction et une sonde ADN

1. Pour effectuer une PCR, il faut utiliser :

1. Une ADN polymérase ADN dépendante thermostable
2. 4 désoxyribonucléotides monophosphates
3. Un thermocycleur

1. Cocher la (ou les) proposition(s) juste(s)

1. Le SyBRGreen permet de marquer l’ADN
2. La concentration en agarose permet de faire varier la taille de la maille du gel
3. Le séquençage par la technique de Sanger nécessite l’utilisation d’un gel d’agarose dénaturant

1. Cocher la (ou les) proposition(s) juste(s)

1. Le marquage en 5’ par transfert de phosphate nécessite de l’ATP α-32P
2. Le marquage en 3’ par l’enzyme de Klenow peut être réalisé uniquement si l’extrémité du brin d’ADN est 5’ sortant
3. Le marquage interne de l’ADN double brin nécessite une première étape de dénaturation

1. Pour effectuer un marquage non radioactif de l’ADN, on peut utiliser :

1. Un dNTP couplé à un fluorochrome
2. Un dNTP couplé à la biotine
3. L’anticorps anti-digoxygénine pour reconnaitre la streptavidine

1. Dans la technique du Southern-blot :

1. La sonde doit être dénaturée avant son utilisation dans l’étape d’hybridation
2. L’échantillon d’ADN analysé doit être dénaturé avant l’étape de digestion enzymatique
3. Le résultat nous permettra de déterminer précisément la taille du gène recherché

1. Cocher les paires d’enzymes de restriction compatibles

1. Bam HI (G/GATCT) et Mbo I (/GATC)
2. Sma I (CCC/GGG) et Hae III (GG/CC)

A. Msp I (C/CGG) et SmaI (CCC/GGG)

1. Cocher la (ou les) bonne(s) réponse(s) concernant le clonage

1. Le clonage n’est pas orienté si 2 enzymes de restriction compatibles sont utilisées
2. Les vecteurs sont toujours déphosphorylés en 5’
3. La sélection (bactérienne) précède l’étape de criblage

1. La transformation des bactéries s’effectue par

1. Des vecteurs recombinants uniquement
2. Le mélange (produit) de ligation
3. Des molécules préalablement triées et sélectionnées

1. L’étape de criblage

1.         Ne nécessite pas de transfert des colonies bactériennes sur filtre lorsqu’elle repose sur l’utilisation de la PCR
2.         Nécessite un transfert des colonies sur filtre lorsqu’elle repose sur de la cartographie physique
3.         Peut être réalisée, en première étape, grâce à la couleur que prennent les colonies de bactéries (par exemples blanches ou bleues) en présence d’un substrat (par exemple X-gal)

1. Lors de la purification de l’ADN plasmidique à partir de bactéries

1. La température est utilisée pour dénaturer l’ADN
2. La soude est utilisée pour dénaturer l’ADN
3. L’ADN chromosomique bactérien est séparé de l’ADN plasmidique après centrifugation

1. Le criblage par interruption de gène

1. S’effectue avant l’étape de sélection
2. Nécessite un vecteur d’expression qui permettra d’exprimer ou non le produit du gène qui sera interrompu ou non
3. Permet de distinguer les bactéries transformées des bactéries non transformées

1. Concernant le séquençage de l’ADN selon Sanger

1. Les « dye terminators » (terminateurs de chaîne) correspondent à des dNTP couplés à des fluorochromes
2. Les ddNTTP sont marqués avec de la radioactivité
3.         Actuellement, les résultats sont présentés sous forme de chromatogrammes (succession de pics)

1. Concernant les banques d’ADN génomique

1. Elles peuvent être réalisées à partir de n’importe quel tissu d’un organisme
2. Elles nécessitent la purification des ARN messagers
3. Elles exigent une digestion ménagée des échantillons d’ADN génomique

1. Concernant les banques d’ADNc

1. Elles sont spécifiques d’un tissu donné
2. Elles nécessitent la purification des ARN totaux
3. Elles sont obtenues par PCR suivie d’une étape de Reverse Transcription

1. Concernant les vecteurs d’expression

1. Ils présentent un promoteur en aval du site Multiple de Clonage (MCS)
2. Ils sont utilisés lorsque l’on veut transcrire un ARN à partir du fragment d’ADN cloné
3. La nature du promoteur dépend de la cellule hôte utilisée

B- Exercice :

Vous travaillez sur la maladie d’Alzheimer et vous vous intéressez à une protéine nommée alpha- synucléine qui joue un rôle central dans cette pathologie humaine. Après une étude bibliographique sur le sujet, vous demandez à une équipe de recherche une construction appelée pGEX-α-syn.h correspondant à l’insertion d’une séquence d’ADN permettant l’expression de la protéine alpha- synucléine humaine recombinante dans le plasmide pGEX.

Malheureusement, votre correspondant ne vous a envoyé que quelques ng de plasmides et a oublié de joindre sa carte physique. Vous trouvez dans un catalogue la carte du plasmide pGEX parental (figure 1). En fonction des informations trouvées sur cette carte, vous décidez d’établir vous-même la carte du plasmide recombinant en effectuant différentes digestions enzymatiques et vous obtenez les résultats présentés figure 2.

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