Régulation androgénique du microARN miR-135a et implication dans la progression tumorale prostatique

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THÈSE

en vue de l'obtention du grade de

Docteur de l’Université de Lyon, délivré par l’École Normale Supérieure de Lyon

Discipline : Sciences de la Vie

Laboratoire Génomique fonctionnelle des récepteurs nucléaires de l’Institut de Génomique

Fonctionnelle de Lyon (IGFL)

École Doctorale Biologie Moléculaire Intégrative et Cellulaire (BMIC)

présentée et soutenue publiquement le 24 Septembre 2013

par Madame Auriane KROISS

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Régulation androgénique du microARN miR-135a

et implication dans la progression tumorale prostatique

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Thèse encadrée par Mme Nathalie ALLIOLI et dirigée par M. Jacques SAMARUT

Après l'avis de : M. Marc BILLAUD et M. Stéphan VAGNER

Devant la commission d'examen formée de :

Mme Nathalie ALLIOLI, Université Claude Bernard Lyon 1, Membre

M. Marc BILLAUD, Université Joseph Fourier Grenoble, Rapporteur

M. Jocelyn CERALINE, Université de Strasbourg, Membre

M. Jacques SAMARUT, ENS de Lyon, Directeur

M. Stéphan VAGNER, Université Paris Sud-11, Rapporteur

M. Jean-Marc VANACKER, ENS de Lyon, Membre

tel-00965286, version 1 - 25 Mar 2014

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ADRESSES :

Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon

ENS de Lyon - CNRS UMR 5242

46, allée d'Italie

69364 Lyon cedex 07

Adresse du laboratoire où la thèse a été préparée :

Centre Hospitalier Lyon Sud, Bâtiment Faculté de Médecine

165, chemin du grand Revoyet

69600 OULLINS

tel-00965286, version 1 - 25 Mar 2014

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REMERCIEMENTS

Je tiens d’abord à remercier mon directeur de thèse, Jacques SAMARUT, pour m’avoir

accueillie et permis de préparer une thèse dans son laboratoire. C’est un réel honneur d’avoir

pu travailler avec vous.

Je souhaite tout particulièrement remercier Nathalie ALLIOLI, qui m’a encadrée depuis

mon master 2 jusqu’à la fin de ma thèse. Tu m’as presque tout appris dans ce métier, depuis la

réalisation des manipulations jusqu’à la retranscription des résultats en communications orales

ou écrites, et je t’en suis très reconnaissante. Je te remercie pour ta pédagogie mais aussi pour

ta patience, ta rigueur et ta volonté, que tu as su me transmettre. Je te remercie pour ton

implication dans ce projet et pour toute l’énergie que tu as dépensée à le faire avancer. Enfin,

je te remercie pour ta confiance qui m’a permis d’acquérir une certaine indépendance.

La réalisation de ce projet n’aurait pas été la même sans Séverine VINCENT. Je te

remercie pour tout le travail que tu as fourni dans cette étude ainsi que pour tout ce que tu

m’as apportée. Tu m’as formée à de nombreuses techniques et tu m’as appris beaucoup de

choses dans la vie du laboratoire. J’espère pouvoir devenir un jour aussi organisée que toi.

Merci pour ta gentillesse, ton soutien et pour ton aide précieuse durant toutes ces épreuves.

Nos longues discussions d’entre-paillasse vont me manquer. Je te remercie pour tous ces

moments scientifiques passés ensemble mais aussi pour tous les autres (soirées

cinéma/m&m’s, boissons au concombre, aprèm gâteaux et vide-grenier sous la pluie).

Je tiens également à remercier tous les autres membres de l’équipe, passés et présents

et plus particulièrement ceux que j’ai pu côtoyer à Lyon Sud et qui ont participé de près ou de

loin à ce projet : Virginie VLAEMINCK-GUILLEM, Anne-Marie BIROT, Myriam

DECAUSSIN-PETRUCCI, Alain RUFFION, Emmanuel COMBE, Juliette LE DOUCE et

Nicolas BEDEL. Merci Virginie et Anne-Marie pour votre soutien scientifique ainsi que pour

votre gentillesse et votre bonne humeur quotidiennes. Votre départ s’est fait ressentir et les

cours avec toi Virginie ont été un réel plaisir. Merci Myriam et Alain pour la collecte des

tissus prostatiques et des informations clinico-pathologiques. Merci aussi à Myriam pour

l’analyse des lames.

En dehors de l’équipe, je tiens à remercier Emmanuelle MEUGNIER et Frédéric

CHALMEL pour l’analyse des puces et Julien DUGAS pour les analyses statistiques. Je

tel-00965286, version 1 - 25 Mar 2014

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remercie également Christophe CHAMOT et Claire LIONNET du PLATIM pour m’avoir

appris à utiliser le Time Laps et à analyser les données. Enfin, je remercie Céline MICHAUX,

Karine CASTELLANO et Béatrice BANCEL, pour leur aide technique dans la

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