Notion de Biochimie

Chapitre O – notion de biochimie

1. Définition

La chimie étudie la matière et les réactions dans la matière ; Bio = vivant
La Biochimie est donc l’étude de la matière vivante et des réactions chimiques liés à la vie.

La matière vivante est constituée de molécules minérales (NaCl ; CaCO3 ; CaPO4…) et de molécules organiques.

Les molécules organiques sont toute construites à base de carbone. Les carbones sont disposés en chaine ou en cycle.

Le carbone est dit tétravalente car va effectuer 4 liaisons covalente pour saturer sa dernière couche.
L’oxygène est dit bivalent car peut établir deux liaisons.
L’azote a trois liaisons possibles.
On trouve également du phosphore et du soufre

1. Les biomolécules

Il existe 4 familles : glucide ; lipides ; protides et les acides nucléique

1. Les glucides

1. Caractéristiques des glucides

Ils sont constitués de carbone ; d’hydrogène et oxygène, on les appelle aussi hydrate de carbone.

Seuls les végétaux fabriquent des glucides, par photosynthèse. Ils sont apportés à l’homme par la nourriture à base de végétaux.
Les glucides représentent une réserve d’énergie facilement disponible pour le fonctionnement de nos cellule
Pour chaque cellule on a une formule générale :  
Les glucides seront en cycle de carbone qui porterons des fonctions alcool OH et des fonctions aldéhyde ou cétone.
Il existe plusieurs types de glucide :[pic 1]

1. Les oses = glucides simples

Sont composé d’entre 3 et 8 carbones ; on les distingue par leur fonction alcool, aldéhyde ou cétone.
ex : glucose, fructose, galactose, ribose, mannose.

1. Le glucose : soluble dans l’eau, peut être fermenté par des bactéries/levure
2. Classification des oses :

Glucose / galactose / mannose 🡪 HEXOSE à 6 C
Ribose / fructose 🡪 PENTOSE à 5 C

1. Les diholosides (deux oses)

Saccharose= glucose + fructose
Lactose =glucide du lait des mammifères, association de glucose + galactose
Maltose= glucose + glucose
      🡪 association de deux oses par liaison osidique

1. Polyholosides = association de plusieurs oses par liaison osidique

1. L’amidon : réserve chez les végétaux, aliment de base chez l’homme. C’est un sucre lent. (Enzyme casse les liaisons de glucose)
2. La cellulose : sert à la rigidité du tissu végétal. Chez l’homme la cellulose ne va pas être découpé elle va partir dans les intestins (pas les bonnes enzymes, alors que certains animaux oui)

L’H l’utilise pour favoriser le transit intestinal

1. Le glycogène : chaine de glucose. Il est présent dans la cellule animale et représente une réserve de glucose. Il est très présent dans le foie et les muscle. Le glucose est ingéré et l’H/animal  assemble le glucose en glycogène pour le stocker

1. Les hétérosides : molécules qu’on trouve chez les végétaux. C’est l’assemblage d’un ose + autre végétaux
   ex : digitaline (= cardiotonique chez la digitale)

1. Les protides

1. Composition et classification

Ils sont composés de C, de H, de O et de N. On trouve parfois des protides avec du soufre et/ou du phosphore en plus.
Les plus simple molécules sont les acides aminés.
Plusieurs acide aminée forment un peptide
Des milliers d’acide aminée forment des protéines

1. Les acides aminés

1. Structure générale

1. Classification

Les acides aminés sont classés en trois ≠ groupes : - les acides (car fonction acide )
                                                   -  les basiques (car fonction amine )
                                                   - les neutres (fonction acide = fonction amine)[pic 2][pic 3]

1. Les protéines

1.  ??  = longue chaîne d’acide aminée. Ils sont liés par des liaisons peptidiques qui s’établissent entre la fonction acide du 1er et fonction amine du 2ème 
2.  Les peptides en biologie

Protéine de structure : protéine qui constitue des structure * myosine= protéine du tissus musculaire
                                                              * collagène= protéine dans la peau ; tendons ; os

Enzymes :  la présence des enzymes est indispensable pour la réalisation de réaction biochimique. Sans elle : pas de réaction
chaque enzyme est spécialisé dans une réaction donnée (ex : oxydase 🡪 oxydation
                                                          polymérase 🡪 assemble molécule
                                                         Réductase 🡪 réduction)

Hormones : ex : insuline qui fait diminuer la glycémie // hormones de croissance qui stimule la croissance

Protéine de transport : prend en charge une molécule et la transporte ailleurs.
ex : * hémoglobine (dans les globules rouge) rôle est de transporter O2 et CO2
      * Lipoprotéines : transport des lipides, du cholestérol

Récepteurs : aura une forme spécifique conçu pour recevoir une molécule qui aura la forme adapté (serrure-clé). On utilise le terme de spécificité. Le récepteur est spécifique à une substance

Protéine de défense : aussi appelé anticorps (AC) se sont des immunoglobulines

1. La structure des protéines dans l’espace

Structure primaire : enchaînement des acides aminée

Structure secondaire : la chaîne d’acide aminée n’est pas linéaire, elle peut être plissé ou en hélice

Structure tertiaire : liaison au sein des chaînes, molécule en 3D

Structure quaternaire : est liée à l’assemblage de plusieurs protéines, ce sont des sous unités (ex : hémoglobine)

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