Enzymologie PACES partie 1

UE 1 : Enzymologie p1

Caractéristiques des enzymes : Généralités
Enzyme (E) : Catalyseur d’une réaction chimique dans un milieu biologique
Le milieu biologique peut être divers : intracellulaire, extracellulaire, circulation sanguine etc…
Substrat (S) : Molécule qui entre dans une réaction catalysée par une enzyme pour y être transformée.
Les substrats peuvent être de natures biochimiques très variées :
- acide aminé, peptide, protéine…
- lipide (AG, cholestérol…)
- glucide (ose simple, disaccharide, polysaccharide…)
- acide nucléique (ADN, ARN)
Produit (P) : Molécule qui apparait au cours de la réaction catalysée par l’enzyme.

Réaction générale : cas d’une réaction faisant intervenir un seul substrat et conduisant à la formation d’un seul produit
E + S 🡸🡺 ES 🡸🡺 E + P
2 étapes :
- liaison du substrat sur l’enzyme,
- transformation du substrat et formation du produit.
Ainsi
- l’enzyme et le substrat conduisent à la formation d’un complexe intermédiaire ES,
- dans ce complexe EZ se produit la réaction catalytique,
- et cette réaction conduit à la formation du produit et à la libération de l’enzyme

Caractéristiques communes / essentielles des enzymes
Les enzymes diffèrent par leur structure, par la réaction qu’elles catalysent, mais elles partagent des propriétés communes.
Nature : Ce sont presque toujours des protéines, à l’exception des ribozymes qui sont des ARN doués d’une activité catalytique.
=> Les enzymes protéiques sont :
        - toujours des protéines globulaires (avec une structure primaire, secondaire tertiaire)
        - souvent oligomériques (avec une structure quaternaire)
Taille : Elle varie de plusieurs centaines à plusieurs milliers de résidus d’acides aminés. La taille de l’enzyme est généralement supérieure à la taille du substrat.
Double spécificité :
- Vis-à-vis de la réaction : une enzyme catalyse un type de réaction donné
- Vis-à-vis du substrat : - réaction pour 1 ou plusieurs substrats
                                   - spécificité étroite ou large

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