Étude d’association à l’échelle du génome

Étude d’association à l’échelle du génome

Identifie le premier locus associé à

Sensibilité au veineux cérébral

Thrombose

Objectif : La thrombose veineuse cérébrale (TVC) est une forme rare d’AVC qui touche surtout les jeunes. Bien que l’on pense que les facteurs génétiques jouent un rôle dans cette condition vasculaire cérébrale, son étiologie génétique n’est pas bien comprise.

Méthodes : Une étude d’association à l’échelle du génome a été réalisée pour identifier les variantes génétiques influençant la susceptibilité à FPC. Une étude à deux stades à l’échelle du génome a été entreprise chez 882 Européens chez qui la FPC a été diagnostiquée et 1 205 groupes ethniques.

Sujets témoins appariés divisés en ensembles de données de découverte et de réplication indépendante

Résultats : Dans l’ensemble de la cohorte cas-témoins, nous avons identifié des associations très significatives avec 37 polymor-nucléotides simples phisms (SNPs) in the 9q34.2 region. The strongest association was with rs8176645 (combined p = 9.15 10 24 ; cotes ratio [RC] = 2,01, intervalle de confiance [IC] à 95 % = 1,76–2,31). Les constatations de l’ensemble de découvertes ont été validées au moyen d’un

Le score de risque génétique pour cette région du 9q34.2 augmente le risque de FPC par une estimation commune OR = 2,65 (95%IC = 2,21–3,20, p = 2,00 10 16). Les SNP de cette région étaient fortement en déséquilibre de couplage (DA) avec les régions de codage du gène ABO. Le groupe sanguin ABO a été déterminé à l’aide d’une combinaison allèle de SNP rs8176746 et rs8176645.

Les groupes sanguins A, B ou AB étaient à 2,85 fois (IC à 95 % = 2,32–3,52, p = 2,00 10 16) risque accru de FPC comparé avec des individus du groupe sanguin O.

Interprétation : Nous présentons la première région chromosomique à s’associer de manière robuste à une susceptibilité génétique à la FPC. Ceci région plus du double de la probabilité de FPC, un risque supérieur à tout risque génétique de thrombophilie précédemment identifié marqueur. Que la variante identifiée est en LD forte avec la région codante du gène ABO avec des différences dans le sang

La prévalence de groupe fournit de nouvelles informations importantes sur la physiopathologie de la FPC

la thrombose veineuse érébrale (TVC) est peu commune

état cérébrovasculaire affectant principalement les jeunes

personnes et représentant <1 % de tous les cas d’AVC.1,2 Incidence

Les taux varient de 1,32 à 1,57 cas par 100 000 personnes-années avec un taux de 3,7 à 5,3 fois plus élevé chez les females1,3 et est associé avec un taux de mortalité élevé de 10 à 35%. 4,5

La FPC dans les pays à revenu élevé est de 1,3 à 1,6 pour 100000

est plus élevé dans les pays à revenu faible et intermédiaire.6

De nombreux facteurs de risque ont été signalés pour la FPC chez les adultes, y compris l’utilisation de contraceptifs oraux, la grossesse, la tête et infections du cou, obésité, anémie, maladies hématologiques, syndrome antiphospholipidique, maladie inflammatoire de l’intestin, élevée altitude, utilisation du tamoxifène, érythropoïétine, phytoestrogènes et utilisation de lidomide dans le myélome multiple.3,7

La composante génétique de la FPC n’a été évalués à l’aide d’études de gènes candidats avec a priori

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