Les protéines membranaires

Les protéines membranaires

Il y a des protéines transmembranaires qui traversent la bicouche lipidique et des protéines

membranaires périphériques associées à la surface externe ou interne de la bicouche.

Les protéines transmembranaires

De nombreuses protéines transmembranaires ne présentent qu'un seul segment peptidique

traversant la membrane. Elles sont amphiphiliques :

-une partie médiane est hydrophobique et se lie avec les extrémités hydrophobes des

lipides à l’intérieur de la bicouche lipidique. Il s'agit de résidus hydrophobes au nombre de 25

qui s'organisent en hélice . Cette hélice  interagit avec les chaînes hydrocarbonées des

lipides plutôt qu'avec l'eau. Ces hélices  ont tendance à s'organiser en homodimère.

-les extrémités sont hydrophiles et sont exposées à l’eau de chaque coté de la

membrane. Des sites potentiels de glycosylation peuvent être présent sur la face

externe de la cellule.

Les protéines qui traversent plusieurs fois la membrane cellulaire se présentent sous forme d'

hélices  et de feuillets . Toutes les amides et les fonctions carbonyles du squelette

polypeptidique sont engagées dans des liaisons hydrogène pour minimiser l'énergie nécessaire

à l'enfouissement du squelette dans la bicouche lipidique hydrophobe. La plupart des chaînes

latérales d'acides aminés en contact avec les chaînes acylées des acides gras de la bicouche

sont hydrophobes.

Les protéines qui ne comportent que des segments transmembranaires formés d'hélices  sont

les plus fréquentes. C'est le cas des pompes, des transporteurs, de nombreux canaux ioniques

et de la cytochrome oxydase. Toutes ces protéines présentent des résidus polaires ou chargés

qui sont tournés vers l'intérieur de la protéine et à l'opposé des lipides.

Les porines (bactérie, mitochondrie) sont constitué de feuillets  qui s'organisent en tonneau

qui présente une surface externe hydrophobe et un canal interne.

De nombreuses protéines transmembranaires sont constituées de plusieurs sous-unités qui

s'associent dans la bicouche membranaire. Beaucoup de canaux ioniques sont formés de 4

sous-unités identiques qui délimitent un pore interne. Les récepteurs de l'acétyl choline sont

des pentamères de sous-unités identiques ou similaires. Celles-ci forment un canal interne

cationique

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