Compte Rendu De Filtration

TD1 Exercice 4. Correction dirigée

On dispose de deux séquenceurs de peptides présentant des caractéristiques techniques différentes.

A permet d’avoir un rendement moyen à chaque étape de seulement 80%, mais il est par contre très sensible et peut détecter jusqu’à 8 10-9 moles de produit.

B permet d’avoir un rendement moyen à chaque étape de 95%, mais n’est sensible que jusqu’à 36 10-9 moles de produit.

a- Lequel des deux appareils utiliseriez-vous pour séquencer 74 10-9 moles d’un peptide de 11 résidus ? Justifiez votre réponse.

b- Dans le cas où l’on dispose de 50 10-9 moles d’un peptide quelconque, combien de résidus chacun des deux séquenceurs permet-il d’identifier ?

TRAVAIL PERSONNEL DIRIGE

Présenter la réaction d’Edman qui est utilisée par les séquenceurs.

Donner les conditions de la réaction.

Donnez le nom du réactif

Donnez le nom du produit

Quelle propriété du produit est utilisée pour l’identifier ?

a- Lequel des deux appareils utiliseriez-vous pour séquencer 74 10-9 moles d’un peptide de 11 résidus ? Justifiez votre réponse.

Un séquenceur qui travaille sur une quantité de 100 nmol de peptides avec un rendement de 90% à chaque étape donnera les résultats suivant à l’étape n :

Etape 1 : 100 nmol

Etape 2 : 100 nmol avec R = 0.9 donnera une quantité d’aa Q = 100*R

Etape 3 : 100*R nmol avec R=0 .9 donnera une quantité d’aa Q = 100*R*R =100*R2

Etape 4 : 100*R*R nmol avec R=0 .9 donnera une quantité d’aa Q = 100*R*R*R = 100*R3

Trouvez l’équation générale permettant de calculer la quantité d’acides aminés libérés à l’étape n.

La quantité de produit initiale est de 79.10-9 mol de peptides de 11 acides aminés

Le séquenceur A : R = 80% pour chaque étape, sa sensibilité est de 8.10-9 mol de produit

Le séquenceur B : R =0.95 pour chaque étape, sa sensibilité est de 36.10-9 mol de produit

Avec le séquenceur A : Q11 = 6.35.10-9 mol ce qui est trop proche de la sensibilité de l’appareil, et rendra la mesure des dernières étapes peu fiables

Avec le séquenceur B : Q11 = 42.10-9 mol ce qui supérieur à la sensibilité de l’appareil, et permet les mesures des dernières étapes.

b- Dans le cas où l’on dispose de 50 10-9 moles d’un peptide quelconque, combien de résidus chacun des deux séquenceurs permet-il d’identifier ?

On dispose de Q1 = 50.10-9 mol de produit à l’étape 1

On peut détecter les dérivés PTHaa jusqu’à la sensibilité de l’appareil, donc lorsque Qn < S il n’est plus possible de détecter les molécules.

Trouvez n en utilisant l’équation obtenue à la question

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